主要浮游生物网、浮游生物连续记录器和浮游生物泵等。浮游生物网可分为简单式浮游生物网和复合式浮游生物网两类。世界上个简单式浮游生物网是 1828年研制出来的，用来捕捉小蟹和藤壶幼虫。简单式浮游生物网由网口、网衣、网底取样瓶、桶和囊袋构成。网口由边框支撑，呈圆形、三角形或长方形等形状；网衣与网口连接，网眼大小规格很多，可根据采集对象的大小加以选用。网底取样瓶附在网衣末端，用以收集网中的浮游生物样品。复合式浮游生物网是在网架上装配若干个网，可同时采集不同水层中的浮游生物样品先进的复合式网配备有环境监测仪器,用电子计算机处理资料，显示环境参数和网位深度、网滤水量等数据。浮游生物连续采集器是1936年发明的，使用时拖于船尾，在船航行时连续采集浮游生物样品（见图[浮游生物连续采集器]浮游生物连续采集器）。采集器主要由水雷形管子、筛绢、卷轴、潜水板、齿轮箱、福尔马林池等部分组成，通过管内缓缓卷动的筛绢不断过滤进入仪器中的海水，得到浮游生物样品。浮游生物泵是抽取海水的离心泵，抽取的海水经筛绢过滤便可得到浮游生物样品。

    包括底拖网、采泥器和柱状取样管。底拖网由长方形或三角形的架子和袋形网构成，用船拖曳在海底采集底栖生物样品。采泥器有蚌式采泥器、弹簧采泥器等，依靠重力或弹力将两个颚瓣插入海底表层沉积物内取样。柱状取样管靠降落时自身的重量插入底质中，采集小型底栖生物样品。

    主要工具是挂板。将挂板放置在预测地点，按规定时间取回，获取污着生物样品。试验挂板分木质和非木质两类，规格分为年板、季板和月板。

    主要包括微生物采水器、采泥器和柱状取样管等。微生物采水器用于采集海水中的微生物样品，有佐贝尔采水器、复背式采水器和无菌采水袋等。常用的佐贝尔采水器由机架和采水瓶两部分组成，将其沉放到预定深度时，投放下坠铁块敲击杠杆后部，杠杆前端挑起，将玻璃管击断，使海水进入采水器瓶内。复背式采水器由一个厚壁橡皮球附加在颠倒采水器上构成，采水器颠倒时，把球口上的塞子拉下，海水进入橡皮球中。无菌采水袋由无菌塑料袋和采水机架组成，采水袋沉放到预定采水深度时，使锤或切刀将水嘴打开，海水流入。采泥器和柱状取样管也可用来采集底质中的微生物样品。